Podobnou tradici jako bramborářství má na Vysočině živočišná výroba, a zejména chov skotu. Počet chovaných kusů skotu je na Vysočině ze všech krajů dlouhodobě nejvyšší a tomu odpovídá například i produkce mléka. Jednoduše řečeno je každý pátý litr českého mléka z Vysočiny.
Tabulka – Počet kusů chovaného skotu v krajích v roce 2007
Graf – Stavy skotu ke konci 2. pololetí 2007
Chov prasat je náročný na spotřebu obilovin, a proto se soustřeďuje na jižněji položené Třebíčsko, kde se obilovin pěstuje v porovnání s ostatními částmi kraje více. Mezi českými chovy prasat jsou ty z Vysočiny druhé nejintenzivnější; v počtu chovaných prasat je Vysočina třetí mezi kraji.
Téměř polovina vysočinské drůbeže se chová na Třebíčsku. Žďársko zase vyniká chovem ovcí, kozy pak najdeme na Třebíčsku a Havlíčkobrodsku.
Tabulka – Počet hospodářských zvířat k 1. dubnu 2007 podle krajů
Ekologické zemědělství
Hospodaření šetrné k přírodě, bez umělých hnojiv a pesticidů se v kraji dynamicky rozvíjí. Nejvíce je zastoupen chov skotu bez produkce mléka.
Graf – Počet ekofarem k 31. 12. 2007 v kraji Vysočina
Graf – Výměra půdy v ekologickém hospodaření v ha k 31. 12. 2007 v kraji Vysočina