Na veřejnou vlakovou dopravu kraj přispěl 253 960 000 Kč, na žákovské jízdné 7 000 000 Kč. Doplatek na jednoho obyvatele kraje tak v přepočtu činí 513 Kč za rok.
Kraj má smlouvu o závazku veřejné služby – základní dopravní obslužnosti – uzavřenou se dvěma dopravci (České dráhy, a. s., a Jindřichohradecké místní dráhy, a. s.).
Celková délka tratí na Vysočině činí 592 kilometrů a hustota železniční sítě je 0,086 km tratě/km2, což je druhá nejnižší hodnota v rámci České republiky. Železniční síť pokrývá 195 z 704 obcí kraje.
Vysočinou projede za běžný pracovní den (24 hodin) 389 vlaků regionální dopravy a 40 rychlíků.
Ze 704 obcí má 83 % zajištěnou dopravní obslužnost jen autobusem, 16 % obcí autobusem i vlakem a pouze 4 obce jen vlakem (Sedlejov, Mysliboř a Slaviboř na Jihlavsku a Plačkov na Pelhřimovsku).
Graf – Rozdělení autobusových dopravců do skupin podle počtu ujetých kilometrů základní dopravní obslužnosti v roce 2007