V roce 2006 hospodařil Kraj Vysočina stejně jako v předchozích letech tak, že bylo dosaženo převahy zdrojů rozpočtu nad jeho výdaji. Příjmy a výdaje krajů s posilováním jejich faktického vlivu stále narůstají. V roce 2006 tvořily příjmy Vysočiny 7,863 miliardy Kč, výdaje 7,611 miliardy Kč.
Graf – Vývoj rozpočtu kraje Vysočina v letech 2001–2006 (v tis. Kč)
V září 2006 kraj přijal první část úvěru Evropské investiční banky ve výši 150 milionů Kč. Úvěr je úročen pohyblivou úrokovou sazbou a úroky kraj splácí pololetně vždy k 15. březnu a 15. září. Jistina se začne splácet 15. 9. 2008 a bude se splácet pololetně rovnoměrnými splátkami až do 15. září 2028. Splatnost úvěru je tedy 20 let od začátku splácení jistiny. Druhou část úvěru ve výši 350 milionů Kč kraj přijme v roce 2007.
Jde o první velký úvěr v historii Vysočiny o celkové částce 500 milionů Kč. Peníze jsou určené výhradně na opravy silnic.
Graf – Struktura příjmů kraje Vysočina v roce 2006 v mil. Kč
Graf – Struktura výdajů kraje Vysočina v roce 2006 v mil. Kč