Vyjádřením zájmu kraje o talentované žáky a studenty kraje Vysočina, kteří navštěvují 5. třídy ZŠ až 4. ročníky SŠ (včetně víceletých gymnázií) a kteří dlouhodobě dosahují v určitém oboru mimořádných výsledků a svůj talent a nadání cílevědomě rozvíjejí, je Stipendium Vysočiny. Z celkového počtu 86 zaslaných návrhů na cenu Talent Vysočiny 2006 komise nominovala celkem 41 žáků a studentů, z toho bylo 9 oceněno formou desetiměsíčního stipendia (celková částka 130 000 Kč) a 32 formou jednorázového stipendia (celková částka 51 000 Kč). Žáci a studenti ocenění desetiměsíčním stipendiem od září 2006 do června 2007 pravidelně dostávají částku ve výši 1 000 nebo 2 000 Kč. Tito žáci a studenti získali současně ocenění Talent Vysočiny 2006 v oboru, v němž byli nominováni.
Kraj dotuje také aktivity Rady dětí a mládeže kraje Vysočina. Ta sdružuje organizace pracující s dětmi a mládeží v jejich volném čase a je partnerem kraje pro komunikaci s neziskovými organizacemi, které působí v oblasti dětí a mládeže. Díky krajské dotaci ve výši 200 000 Kč například rada vydala 3. ročník brožury o letních táborech na Vysočině; tento přehled táborů byl k dispozici i v elektronické podobě na speciálních webových stránkách.
V roce 2006 dofinancoval Kraj Vysočina 21 evropských projektů škol realizovaných v rámci vzdělávacích programů EU (Socrates, Leonardo da Vinci a Mládež) a programu INTEREG III.A částkou 1 194 930 Kč.
V roce 2006 se opět uskutečnila Regionální velká výměna zkušeností (RVVZ), která je největším setkáním vedoucích dětských oddílů jakékoliv organizace, rádců či instruktorů, pracovníků center volného času a dalších zájemců z Vysočiny, kteří pracují s dětmi ve volném čase. Pořádalo ji Občanské sdružení Hodina H a zúčastnilo se jí několik desítek účastníků, lektorů a organizátorů. Kraj Vysočina akci podpořil částkou 30 000 Kč.