Celkové přímé náklady na hlavní činnost všech škol a školských zařízení Vysočiny činily 3 917,3 milionů Kč, z toho náklady na platy 2 642,2 milionů Kč.
Mzdové náklady ve školství hradí stát formou účelové dotace. Kraj financuje především investiční, a hlavně rozvojové a nadstavbové aktivity.
V roce 2006 se na Vysočině uskutečnilo více než 30 postupových soutěží a přehlídek vyhlašovaných a podporovaných Ministerstvem školství. Okresních a krajských kol jednotlivých sportovních i nesportovních soutěží se zúčastnilo přibližně 25 000 žáků a studentů. Celkové náklady na zabezpečení, poskytnuté organizátorům, činily 2,2 milionu Kč, z toho z rozpočtu ministerstva 1,3 a z rozpočtu kraje 0,9 milionu Kč.
V závěru školního roku získali vítězové krajských kol vybraných soutěží, vyhlašovaných ministerstvem, tradiční Cenu hejtmana Vysočiny. V roce 2006 získalo ocenění 98 žáků a studentů ze základních a středních škol, kteří si vedle věcných cen odnesli i finanční odměnu v hodnotě od 700 do 4 000 Kč. Celková částka všech finančních odměn činila 114 200 Kč.
Kromě soutěží, organizovaných ministerstvem, podpořil kraj také řadu těch, na kterých se Ministerstvo školství nepodílí. V roce 2006 získalo podporu 36 organizátorů krajských nebo celostátních soutěží a přehlídek pro děti a mládež; částka dosáhla výše 600 000 Kč. Jednalo se například o „Soutěž v předlékařské první pomoci“, „Učeň instalatér“, „Strojař roku“, „Učňovskou zeď“, „Jihlavského slavíka“, „Přehlídku dětských pěveckých souborů“, krajskou vědomostní soutěž „Všeználek“, „Zelenou stezku – Zlatý list“, republikové finále „Sedmikvítku“, „Ekologickou olympiádu“, „Otevřené přebory v sokolské všestrannosti“, krajské soutěže v atletice a další. Příjemci dotace bylo 15 středních škol, 15 organizátorů z řad neziskových organizací, 7 DDM a 1 ZUŠ.